Tras indagar a Jiménez, el fiscal auxiliar, Luis Martínez, anunció que se le acusó formalmente del delito de homicidio culposo y se mantuvo su detención preventiva.
La fiscalía ha solicitado la declaración del dueño del taller de mecánica, Alvis Madrid, y el conductor del bus.
Además, ha pedido todas las pruebas realizadas por la Policía Técnica Judicial y el Cuerpo de Bomberos sobre el vehículo incendiado.
En cuanto a su fuente de energía, el Transmilenio usa un combustible diésel que contribuye notablemente a aumentar la contaminación atmosférica. El Transmilenio también provocó el rápido deterioro de las losas de las vías por las cuales circulan los vehículos en la Avenida Caracas y la Autopista Norte de Bogotá, según la Universidad Nacional de Colombia, al parecer por un error de la cementera mexicana CEMEX en el diseño.
Pese a que muchos usuarios están de acuerdo en que el Transmilenio es una gran mejora frente al sistema de transporte público convencional, crecen las críticas acerca del sistema: las estaciones y los vehículos están repletos, más que la capacidad recomendada y segura, aún durante las "horas no pico". La ATTT anunció que el primer tramo del "Transmilenio panameño" comenzará a construirse a principios del 2007 y se convocará a una licitación previa para otorgar concesiones de la flota de vehículos, así como del sistema general, estaciones, carriles exclusivos y centro de control de semáforos para la ciudad.
Desde el principio, la propuesta se vendió como la opción "barata" e inmediata para combatir el problema del transporte público en las grandes ciudades de América Latina.
Incluso el Banco Interamericano de Desarrollo acogió la idea de financiar.
El pasado 29 de septiembre, el concejal Bruno Díaz señaló en un reporte de Caracol que "jamás Bogotá debió tener el Transmilenio y lo que se necesitaba era un metro", de que los intereses políticos o personales influyeron en la decisión final.