El magistrado José Manuel Faúndes se declaró impedido para conocer el Amparo de Garantía interpuesto por la procuradora suplente, Mercedes Araúz de Grimaldo, contra la resolución No. 54 de 27 de marzo de 2000 emitida por la Asamblea Legislativa mediante la cual se convocó a sesiones judiciales a dicha corporación.
Faúndes estimó que se encontraba impedido para conocer el citado recurso, dado que en él se disponía reanudar las sesiones judiciales dentro del proceso penal seguido en su contra y que esa circunstancia podía afectar la objetividad e imparcialidad en su actuación.
La Corte Suprema de Justicia acogió como buena el impedimento de Faúndes, pero se desconoce a quién corresponderá conocer del proceso, ya que su suplente Humberto Collado falleció recientemente y aún no se ha nombrado a su reemplazo.
La procuradora suplente Araúz de Grimaldo presentó un recurso contra la convocatoria de sesiones judiciales de la Asamblea Legislativa para votar por la condena o absolución de Faúndes, pero el proceso se ejecutó ya que el recurso no suspendió el acto.
Faúndes fue absuelto por el Pleno de la Asamblea Legislativa y se reincorporó a su cargo de magistrado de la Corte Suprema de Justicia, por lo que le tocó conocer del recurso presentado por Araúz de Grimaldo contra el acto en donde sería dictado su fallo por parte de la Asamblea.
En la actualidad Faúndes se encuentra a la espera de que le sean pagados cerca de B/.400,000 en concepto de salarios caídos, tras su separación del cargo por espacio de casi tres años como magistrado de la Corte Suprema de Justicia.