En el caso de los hermanos Arellano Félix, estos ingresaron a la organización del narcotráfico por su primo Miguel Ángel Félix Gallardo, quien manejaba el imperio de la droga desde Culiacán, estado de Sinaloa, hasta que en 1989 fue encarcelado por el asesinato del agente de la DEA Enrique Camarena. Félix Gallardo construyó su imperio contrabandeando marihuana producida localmente y heroína a través de la frontera con Estados Unidos, pero los hermanos Arellano Félix llevaron el negocio en otra dirección.
Para la ejecución de sus actividades ilícitas utilizan el área fronteriza entre Tijuana y Estados Unidos.
Según investigaciones y escritos periodísticos, los Arellano Félix formaron una alianza estratégica con narcotraficantes colombianos para introducir cocaína en Estados Unidos. En una nota publicada recientemente en El Timpo de Bogotá, se indicó que según informes de inteligencia, en el 2002, se celebró una cumbre de la mafia en Panamá, en donde participaron miembros del clan Arellano con capos del cartel del Norte del Valle. En marzo del 2002, las autoridades mexicanas arrestaron al líder del cartel, Benjamín Arellano Félix.
Un mes antes, su hermano Ramón, el jefe de seguridad del cartel, había caído asesinado en Mazatlán en lo que muchos medios interpretaron como una trampa tendida por el cartel de Sinaloa, liderado por Ismael "El Mayo" Zambada.
En el 2003 las autoridades estadounidenses presentaron cargos formales contra 11 presuntos narcotraficantes mexicanos señalados de pertenecer al cartel de Tijuana.
Entre los acusados estaban los hermanos Benjamín, Eduardo y Francisco Arellano Félix, y varios de sus lugartenientes.
En el 2004 la organización sufrió otra baja, Jorge Aureliano Félix, alias "el Macumba" y Efraín Pérez, "el Efra".
En esa época Francisco Javier Arellano Félix, "El Tigrillo" quedó aislado. No es hatas el 2006 que se logra el arresto de "El Tigrillo"
Natural de Sinaloa, la familia Arellano Félix llegó a Baja California a fines de la década de los años ochenta y muy pronto se convirtió en un poder en la sombra en el noroeste mexicano, temidos por otros cárteles como el de Sinaloa.