Según la Autoridad Nacional del Ambiente, Panamá se encuentra en la posición 19 entre los 25 países con mayor riqueza de especies de plantas con flores, y en la posición 4 en Norte y Centro América. También cuenta con los arrecifes más ricos de la región en términos de diversidad y calidad de corales, con 58 especies en el Caribe y 18 en el Pacífico.
En lo que a fauna se refiere, Panamá tiene un 4% de la diversidad total de anfibios y el 3.5% de los reptiles conocidos en el mundo.
