Mediante el Decreto Ejecutivo No.323 de 18 de octubre de 2007, el Ministerio de Educación (MEDUCA) creó dos nuevas regiones educativas en las comarcas Ngöbe Buglé y Emberá Wounaan, ubicadas en las provincias de Chiriquí, Bocas del Toro, Veraguas y Darién.
En la actualidad existen 13 regiones educativas, no obstante, con estas dos nuevas regiones el número aumentó a 15.
El sustento legal de la conformación de las nuevas regiones educativas lo determina la Ley 47 de 24 de septiembre de 1946, Orgánica de Educación, que establece la reorganización escolar como estrategia de planificación y administración del servicio educativo.
Las regiones escolares se dividen en circuitos y zonas escolares, determinadas por el número de centros educativos.