Quizás el presidente Martín Torrijos sea el primer Gran Maestre de la Orden que lleva el nombre de su padre, y tendrá derecho a la Gran Cruz Extraordinaria.
El Decreto Ejecutivo No. 1 de 11 de enero de 2006 modifica disposiciones sobre la Orden General de División Omar Torrijos Herrera, y especifica que el Presidente de la República es el Gran Maestre de la condecoración.
El Gran Concejo de la Orden lo presidirá el ministro de Relaciones Exteriores, en su condición de Gran Canciller; y lo integrarán además el ministro de Gobierno y el rector de la Universidad de Panamá. El viceministro de Relaciones Exteriores será el secretario. El decreto modifica uno en el que se dejó sin especificar las características de algunos grados de la condecoración.
