Las áreas protegidas del Parque Nacional Volcán Barú (PNVB) y el Parque Internacional la Amistad (PILA), que se extienden a lo largo de las Tierras Altas de Chiriquí y se unen con la cordillera costarricense, constituyen las áreas boscosas de mayor importancia porque forma parte del Corredor Biológico Mesoamericano.
El reciente escándalo que desató la intención del pasado gobierno de construir una carretera en medio del PNVB, elevó la conciencia ambiental en defender el futuro de las áreas protegidas, por la cantidad de especies endémica de flora y fauna que habitan en estas zonas boscosas.
Sin embargo, los daños ecológicos como la tala, la caza y la quema son males provocados que no se han logrado sanear.
La ANAM en Chiriquí tiene conocimiento de las incursiones nocturnas de cazadores equipados con armas de fuego en compañía de perros de cacería en las áreas protegidas, situación que no se ha controlado.
Las quemas también arrasan con los bosques en las áreas protegidas. En el 2003 el fuego alcanzó unas 800 hectáreas de bosques secundarios.
La Fundación para el desarrollo integral de Cerro Punta (FUNDICCEP), la Asociación Amigos del PILA (AMIPILA), la Fundación Vida, Salud, Ambiente y Paz (FUNDAVISSAP), el grupo ecológico de Renacimiento para la protección del PILA (GEPROPILA), el Movimiento ecoturístico de Tierras Altas (METTA), son organizaciones que en su mayoría reciben fondos internacionales para gestionar proyectos ambientales en la región chiricana.
