El Programa de Ampliación del Canal Panamá, que aumentó la capacidad para satisfacer el crecimiento de la demanda, no identificó amenazas en materia ecológica, luego de años de evaluación de las diferentes alternativas y los análisis de viabilidad ambiental.
Esto debido a que las actividades de construcción y operación del Canal ampliado son similares a las que la Autoridad del Canal de Panamá (ACP) ha ejecutado por más de cien años, como lo son la excavación, dragado y vaciado de concreto; así como la operación de las esclusas con tres cámaras.

Sin embargo, según la División de Ambiente, Agua y Energía de la ACP, sí hubo consideraciones importantes que fueron incorporadas en los estudios de impacto ambiental y el diseño de las nuevas esclusas.
Las consideraciones fueron la remoción de vegetación secundaria, la prospección de recursos culturales y la indemnización ecológica junto con el mantenimiento del carácter de agua dulce del lago Gatún.

Los especialistas indicaron que en este caso se establecieron las medidas de diseño y de mitigación correspondientes, para cada una de estas consideraciones.
Por otro lado, la ACP indicó que ellos han hecho un total de 20 estudios sobre el agua y tres estudios ambientales. Aunque también cuentan con el apoyo de estudios relacionados con otras instituciones.
Uso de los embalses
La Cuenca Hidrográfica del Canal de Panamá (CHCP) brinda servicios a nivel nacional e internacional, pues el agua almacenada es la fuente de agua potable para las ciudades de Panamá, La Chorrera y Colón, así como otras comunidades a su alrededor, y también aporta el agua para el funcionamiento del Canal de Panamá.
Juan Antonio Ducruet, exdirector del Instituto de Acueductos y Alcantarillados Nacionales (Idaan) y miembro de la Asociación Panameña de Ejecutivos de Empresa (Apede), dijo que una de las labores importantes, luego de que se inaugurara la ampliación, es la realidad hídrica con base en lo que pueden haber cambiado las proyecciones desde el 2006 hasta el 2016.
Aseguró que del Lago Gatún y de las fuentes del Canal se extraen alrededor de 300 millones de galones al día, mientras que del Canal son cerca de 2,000 millones de galones diarios, es decir, que casi un 9% del agua es para uso municipal y el resto, para la operación del Canal.
En Panamá se consumen casi 400 litros por habitantes al día, que comparado con el consumo de otros países de América Latina, resulta ser el más alto, al superar en más del doble el promedio latinoamericano.
Más de la mitad de la población panameña utiliza el agua potable extraída de los lagos del Canal.
La División de Ambiente, Agua y Energía de la ACP indica que la Cuenca está conformada por una amplia red de ríos y quebradas que drenan hacia los embalses de Alhajuela, Gatún y Miraflores.
Entre los ríos y tributarios que drenan hacia el sistema de embalses se encuentran el Chagres, Gatún, Pequení, Boquerón, Trinidad, Cirí, Indio Este, Caño Quebrado y Piedra, entre otros. Este sistema hidrológico se extiende sobre un territorio de 3435 kilómetros cuadrados.
En cuanto al proyecto de suministro de agua de río Indio estimado en unos $500 millones, el Canal destacó que en estos momentos están enfocados en la discusión del Plan Nacional de Seguridad Hídrica (PNSH) para definir hacia dónde deberán llegar, el tema de cómo llegarán debe ser evaluado y estudiado posteriormente.